Antibiotici, naročito oni širokog spektra mogu dovesti do enteritisa koji u nekim slušajevima završavaju fatalno. Enteritisi nastali upotrebom antibiotika se najčešće zapažaju kod konja i zečeva jer se kod obe vrste životinja fermentacija odvija u slepom crevu. Antibiotici dovode do propadanja normalne bakterijske mikroflore, a kao posledica toga dolazi do prekomernog rasta patogenih mikroorganizama usled poremećene ravnoteže između mikroorganizama. Zabezeno je da su brojni antibiotici opasni za kunica. Za vreme borbe sa bakterijskim infekcijama, antibiotici donose gastrointestinalne probleme koji mogu imati fatalne posledice. Disbioza omogućava patogenim bakterijama kao sto je Clostridium spp da raste u digestivnom traktu i proizvodi opasne toksine.

(sin. Borelioza , lat. Borreliosis, engl. Lyme borreliosis, Lyme disease)

Lajmska bolest je multisistemsko oboljenje životinja i ljudi, subakutnog ili hroničnog toka, koje se manifestuje promenama na koži, zglobovima, srcu, nervnom sistemu, očima itd. Bolest ima nepredvidiv tok i sklonost ka recidivima i hronicitetu. Bolest je predominantna u Severnoj Americi ali se javlja i u Evropi, Aziji, Australiji i u Severnoj Africi.

(engl. Transmissible spongiform encephalopathies TSE, sin. Prion diseases)

Transmisibilne spongiformne encefalopatije su neurodegenerativna oboljenja životinja i ljudi sa dugim periodom inkubacije, progresivnim hroničnim tokom bolesti i neizbežnim fatalnim ishodom.

Leptospiroza je akutna, subakutna, ređe hronična bolest mnogih vrsta domaćih, divljih  životinja i čoveka (zoonoza). Leptospiroza se karakteriše septikemijom, hemolitičkom anemijom, žuticom, pobačajima, intersticijalnim nefritisom i pojavom krvave mokraće. Kod krava i ovaca može uzrokovati mastitis, a kod konja mesečno slepilo. Oboljenje  često protiče asimptomatski.